Z BioInf
Skocz do: nawigacja, szukaj
(Kinaza JAK2)
(Kinaza JAK2)
Linia 31: Linia 31:
  
 
{|class="wikitable center" style="text-align:center; font-size:75%; border:1px"
 
{|class="wikitable center" style="text-align:center; font-size:75%; border:1px"
|+Mutacje substytucyjne oraz translokacje chromosomalne onkogennej kinazy JAK2 w chorobach proliferacyjnych krwi
+
|+ <span style="font-size:133%">Mutacje substytucyjne oraz translokacje chromosomalne onkogennej kinazy JAK2 w chorobach proliferacyjnych krwi </span>
 
! Lp.
 
! Lp.
 
! onkogen JAK2
 
! onkogen JAK2
Linia 38: Linia 38:
 
|-
 
|-
 
| rowspan=2|1
 
| rowspan=2|1
| rowspan=2|JAK2V617F
+
| rowspan=2|JAK2<sup>V617F</sup>
 
| czerwienica prawdziwa (choroba Vasqueza)
 
| czerwienica prawdziwa (choroba Vasqueza)
 
| Baxter et al. 2005
 
| Baxter et al. 2005
Linia 46: Linia 46:
 
|-
 
|-
 
| 2
 
| 2
| JAK2L611S
+
| JAK2<sup>L611S</sup>
 
| ostra białaczka limfoblastyczna
 
| ostra białaczka limfoblastyczna
 
| Funakoski-Tago et al. 2009
 
| Funakoski-Tago et al. 2009
 
|-
 
|-
 
| 3
 
| 3
| JAK2K607N
+
| JAK2<sup>K607N</sup>
 
| ostra białaczka szpikowa
 
| ostra białaczka szpikowa
 
| Lee et al. 2006
 
| Lee et al. 2006
 
|-
 
|-
 
| 4
 
| 4
| JAK2D620E
+
| JAK2<sup>D620E</sup>
 
| nieklasyfikowalny syndrom mieloproliferacyjny
 
| nieklasyfikowalny syndrom mieloproliferacyjny
 
| Schnittger et al. 2006
 
| Schnittger et al. 2006
 
|-
 
|-
 
| 5
 
| 5
| JAK2ΔIREED
+
| JAK2<sup>ΔIREED</sup>
 
| ostra białaczka limfoblastyczna komórek prekursorowych B
 
| ostra białaczka limfoblastyczna komórek prekursorowych B
 
| Malinge et al. 2007
 
| Malinge et al. 2007
 
|-
 
|-
 
| 6
 
| 6
| JAK2T875N
+
| JAK2<sup>T875N</sup>
 
| ostra białaczka megakarioblastyczna
 
| ostra białaczka megakarioblastyczna
 
| Mercher et al. 2006
 
| Mercher et al. 2006
Linia 81: Linia 81:
 
| rowspan=3|PCM1-JAK2
 
| rowspan=3|PCM1-JAK2
 
| chłoniaki T-komórkowe
 
| chłoniaki T-komórkowe
| Reiter et al. 2005, Adelaide et al. 2006
+
| Reiter et al. 2005,<br>Adelaide et al. 2006
 
|-
 
|-
 
| atypowa przewlekła białaczka szpikowa
 
| atypowa przewlekła białaczka szpikowa

Wersja z 22:17, 12 maj 2014

Kinaza JAK2

Kinaza JAK2 należy do rodziny niereceptorowych tyrozynowych kinaz białkowych JAK. Kinaza ta jest częścią ścieżek sygnalnych JAK2/STAT3/5 (Signal Transducer and Activator of Transcription) i uczestniczy w transdukcji sygnałów zewnątrzkomórkowych za pośrednictwem cytokin, czynników wzrostu i hormonów. Ma typową dla białek JAK czterodomenową budowę - od C-końca można wyróżnić następujące domeny: JH1, JH2, SH2 oraz FERM. Domena JH1 (aminokwasy 835 do 1132, PubMed NM 004972) kinazy JAK2 jest typową dla komórek eukariotycznych domeną katalityczną o aktywności kinazy tyrozynowej (PTK - Protein Tyrosine Kinase). Spełnia ona trzy kluczowe role: wiązanie i pozycjonowanie donora reszty fosforanowej (ATP, GTP) w kompleksie z dwuwartościowymi kationami (Mg2+, Mn2+), wiązanie i pozycjonowanie substratu peptydowego, a także transfer γ-fosforanu na aminokwas akceptorowy.

Pierwsza poznana struktura domeny kinazowej JAK2 to struktura krystalograficzna kompleksu tej domeny z inhibitorem CMP6 (Lucet et al. 2006). Ma ona typową dla kinaz dwupłatową budowę z płatem N-terminalnym (aminokwasy 840-931) oraz C-terminalnym (932-1132). Pierwszy płat jest złożony z pięciu antyrównoległych wstążek beta i jednej helisy alfa (αC). Drugi natomiast jest zbudowany z ośmiu helis alfa (αD-αK) i trzech par antyrównoległych wstążek beta (β7-β8, β6-β9, β10-β11). Centrum aktywne, wraz z miejscem wiązania cząsteczki ATP, znajduje się w kieszeni pomiędzy płatami, które połączone są tzw. rejonem zawiasowym. W wiązaniu substratów reakcji fosforylacji: cząsteczki ATP oraz białka uczestniczy również pętla aktywacyjna (aminokwasy 994-1024). Autofosforylacja tyrozyn 1007 oraz 1008 działa jak molekularny przełącznik aktywności fosforylacyjnej kinazy JAK2. W wyniku autofosforylacji Tyr1007 oraz Tyr1008 dochodzi do otwarcia pętli aktywacyjnej i przesunięcia motywu DFG (aminokwasy 994-996), oddziałującego z jonami Mg2+, w pobliże centrum aktywnego. Autofosforylacja umożliwia ponadto wiązanie wielu białek regulatorowych, jak SOCS czy PTP. Pętla insercyjna (aminokwasy 1056-1078), charakterystyczna dla wszystkich domen kinazowych JAK, przypuszczalnie zaangażowana jest w regulację fosforylacji tych białek.

Konserwowane elementy struktury domeny kinazowej JAK2
fragment struktury aminokwasy struktura kompleksu domeny kinazowej JAK2 z inhibitorem CMP6 (kod PDB: 2B7A)
rejon zawiasowy 929-935
(MEYLPYG)
JAK2-Rysunek1.png
pętla glicynowa 856-861
(GKGNFG)
pętla katalityczna (motyw PTK – Protein Tyrosine Kinase Active-site Signature) 972-984
(YIHRDLATRNILV)
pętla aktywacyjna (z motywami DFG (994-996) i APE (1022-1024) oraz autofosforylowaną parą tyrozyn Y1007/Y1008) 994-1024
(DFGLTKVLPQDKEYY
KVKEPGESPIFWYAPE)


Znaczenie kinazy JAK2 w chorobach mieloproliferacyjnych


.

Mutacje substytucyjne oraz translokacje chromosomalne onkogennej kinazy JAK2 w chorobach proliferacyjnych krwi
Lp. onkogen JAK2 choroba hematologiczna literatura
1 JAK2V617F czerwienica prawdziwa (choroba Vasqueza) Baxter et al. 2005
nadpłytkowość samoistna i pierwotna mielofibroza Lerine et al. 2005
2 JAK2L611S ostra białaczka limfoblastyczna Funakoski-Tago et al. 2009
3 JAK2K607N ostra białaczka szpikowa Lee et al. 2006
4 JAK2D620E nieklasyfikowalny syndrom mieloproliferacyjny Schnittger et al. 2006
5 JAK2ΔIREED ostra białaczka limfoblastyczna komórek prekursorowych B Malinge et al. 2007
6 JAK2T875N ostra białaczka megakarioblastyczna Mercher et al. 2006
7 TEL-JAK2 ostra białaczka limfoblastyczna Lacronique et al. 2000
atypowa przewlekła białaczka szpikowa Saharinen et al. 2003
8 PCM1-JAK2 chłoniaki T-komórkowe Reiter et al. 2005,
Adelaide et al. 2006
atypowa przewlekła białaczka szpikowa Bosquet et al. 2005
ostra białaczka erytrocytarna Murati et al. 2005
9 BCR-JAK2 atypowa ostra białaczka limfoidalna Griesinger et al. 2005
typowa przewlekła białaczka szpikowa Griesinger et al. 2005
ostra białaczka szpikowa Cirmena et al. 2008
10 RPN1-JAK2 przewlekła idiopatyczna mielofibroza (zwłóknienie szpiku) Mark et al. 2006
11 SSBP2-JAK2 ostra białaczka limfocytarna komórek prekursorowych B Poitras et al. 2008

Mutacje somatyczne w genie jak2 można podzielić na dwie grupy: mutacje punktowe lub kilkuaminokwasowe delecje w wąskim obszarze domeny pseudokinazowej (pozycje 1-6), a także translokacje chromosomalne prowadzące do powstania kinaz fuzyjnych (pozycje 7-11). Mutacje w domenie pseudokatalitycznej znoszą hamujący wpływ tej domeny na domenę katalityczną kinazy, w rezultacie powodując jej nadaktywność. Natomiast dość sporym zaskoczeniem była identyfikacja mutacji punktowej w domenie katalitycznej (pozycja 6). Z kolei w wypadku translokacji chromosomalnych powstają tzw. fuzyjne kinazy JAK2 (FTK, ang. fusion tyrosine kinase, Wilks 2008). Partnerem fuzyjnym C-końcowej części kinazy JAK2 są białka zdolne do oligomeryzacji, co umożliwia autofosforylację kinazy JAK2.