Z BioInf
Linia 8: | Linia 8: | ||
!funkcja / przykład | !funkcja / przykład | ||
|- | |- | ||
− | |A6 K | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |A6 K |
|Tyr | |Tyr | ||
|nieznana | |nieznana | ||
|- | |- | ||
− | |ABC1 | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |ABC1 |
|nieznana | |nieznana | ||
|niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży | |niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży | ||
|- | |- | ||
− | |alfa | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |alfa |
|Ser/Thr | |Ser/Thr | ||
|regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK) | |regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK) | ||
|- | |- | ||
− | |BCR | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |BCR |
|Ser/Thr | |Ser/Thr | ||
|supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3 | |supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3 | ||
|- | |- | ||
− | |BRD | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |BRD |
|nieznana | |nieznana | ||
|regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy | |regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy | ||
|- | |- | ||
− | |FAST | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |FAST |
|Ser/Thr | |Ser/Thr | ||
|regulacja apoptozy | |regulacja apoptozy | ||
|- | |- | ||
− | |G11 | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |G11 |
|Ser/Thr | |Ser/Thr | ||
|nieznana | |nieznana | ||
|- | |- | ||
− | |H11 | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |H11 |
|Ser/Thr | |Ser/Thr | ||
|białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny | |białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny | ||
|- | |- | ||
− | |PDK | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |PDK |
|Ser | |Ser | ||
|regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD) | |regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD) | ||
|- | |- | ||
− | |PIKK | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |PIKK |
|Ser/Thr | |Ser/Thr | ||
|regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji | |regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji | ||
|- | |- | ||
− | |RIO | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |RIO |
|Ser | |Ser | ||
|biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3) | |biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3) | ||
|- | |- | ||
− | |TAF | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |TAF |
|Ser/Thr | |Ser/Thr | ||
|inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID) | |inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID) | ||
|- | |- | ||
− | |TIF | + | !scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |TIF |
|Ser/Thr | |Ser/Thr | ||
|regulacja transkrypcji (TIFα, β i γ) | |regulacja transkrypcji (TIFα, β i γ) | ||
|} | |} |
Wersja z 10:36, 30 lip 2014
Kinazy atypowe (aPK)
Białka należące do grupy atypowych kinaz białkowych (aPK, ang. atypical protein kinase) pozbawione są motywów sekwencji charakterystycznych dla profilu HMM (ang. hidden Markov model) "typowej" domeny kinazowej. Zostały jednak włączone do grupy aPK ze względu na wyraźną aktywność fosfotransferazową lub też homologię sekwencji. Rodziny atypowych kinaz białkowych są zwykle nieliczne. Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli poniżej.
kinaza | specyficzność substratowa | funkcja / przykład |
---|---|---|
A6 K | Tyr | nieznana |
ABC1 | nieznana | niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży |
alfa | Ser/Thr | regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK) |
BCR | Ser/Thr | supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3 |
BRD | nieznana | regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy |
FAST | Ser/Thr | regulacja apoptozy |
G11 | Ser/Thr | nieznana |
H11 | Ser/Thr | białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny |
PDK | Ser | regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD) |
PIKK | Ser/Thr | regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji |
RIO | Ser | biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3) |
TAF | Ser/Thr | inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID) |
TIF | Ser/Thr | regulacja transkrypcji (TIFα, β i γ) |