Z BioInf
(→Adaptive Biasing Force (ABF)) |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| + | =Adaptive Biasing Force= | ||
| + | Jedna z nowszych metod wyznaczania różnic energii swobodnej, a konretniej - potencjału średnich sił (PMF), z którego można wyznaczyć różnice energii swobodnej między stanami meta-stabilnymi. Jej główną zaletą jest uniwersalność; do działania wymaga definicji współrzędnej reakcji ξ('''x'''), będącej funkcją konfiguracji układu. Ponadto, ABF jest nieczuły na problemy związane z przeszukiwaniem przestrzeni konfiguracyjnej (utykanie w lokalnych minimach, eksploracja licznych minimów). Do wad należy zaliczyć skomplikowany formalizm i nieintuicyjność, co utrudnia debugowanie. | ||
Wersja z 10:39, 9 mar 2015
Adaptive Biasing Force
Jedna z nowszych metod wyznaczania różnic energii swobodnej, a konretniej - potencjału średnich sił (PMF), z którego można wyznaczyć różnice energii swobodnej między stanami meta-stabilnymi. Jej główną zaletą jest uniwersalność; do działania wymaga definicji współrzędnej reakcji ξ(x), będącej funkcją konfiguracji układu. Ponadto, ABF jest nieczuły na problemy związane z przeszukiwaniem przestrzeni konfiguracyjnej (utykanie w lokalnych minimach, eksploracja licznych minimów). Do wad należy zaliczyć skomplikowany formalizm i nieintuicyjność, co utrudnia debugowanie.