Mikromacierze DNA

Z BioInf

Mikromacierze DNA

Mikromacierze DNA zwane inaczej chipami DNA lub czujnikami DNA składają się z wielu sond molekularnych przytwierdzonych do stałego podłoża w ściśle określonym porządku. Podłożem tym jest płytka szklana lub plastikowa pokryta specjalną warstwą umożliwiającą efektywne wiązanie sond. Jako sondy molekularne używane są oligonukleotydy różnej długości oraz dwuniciowe cDNA.

W zależności od rodzaju sondy wyróżniamy następujące typy mikromacierzy:

  • mikromacierze oligonukleotydowe o krótkich sondach (18-25 nukleotydów);
  • mikromacierze oligonukleotydowe o długich sondach (50-70 nukleotydów);
  • mikromacierze cDNA, sondy o długości od kilkuset do kilku tysięcy par zasad.

Mikromacierze możemy też podzielić ze względu na sposób umocowania sond:

  • mikromacierze "statyczne", czyli te opisywane powyżej, gdzie sonda jest przymocowana do płytki;
  • mikromacierze "dynamiczne" zwane również przepływowymi (z ang. bead arrays, flow-through technology, microfluidic system), gdzie sonda jest przymocowana do kilku mikrometrowej wielkości ziaren silikonowych lub polistyrenowych, które mogą pływać swobodnie w roztworze.
Osobiste