Z BioInf
(Utworzył nową stronę „==SPLACING== Splacing jest to proces polegający na usuwaniu intronów z pre-mRNA tuż po transkrypcji i połączenia eksonów tak aby dojrzały pre-mRNA przygotowa...”) |
|||
| (Nie pokazano 3 pośrednich wersji utworzonych przez tego samego użytkownika) | |||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
==SPLACING== | ==SPLACING== | ||
Splacing jest to proces polegający na usuwaniu intronów z pre-mRNA tuż po transkrypcji i połączenia eksonów tak aby dojrzały pre-mRNA przygotowany do translacji kodował ciągły łąńcuch polipeptydowy. Proces ten jest kontrolowany przez obecność określonych sekwencji RNA w intronach i eksonach oraz przez wiele czynników białkowych (naważniejsze to rybonukleproteiny -snRNP: U1, U2, U4, U5, U6). Na nici mRNA powstaje dynamiczny kompleks białkowy nazywany spliceosomem. Uczestniczące w nim białka snRNP rozpoznają trzy sekwencje sygnałowe w intronach: na końcu 5’ (sekwencję GU a dla alternatywnego splicingu AU) i 3’ (sekwencję AG a dla alternatywnego splicingu AC) oraz miejsce rozgałęzienia (nukleotyd adeninowy (A)), tworząc z nimi komplementarne połączenia typu RNA:RNA. Skład kompleksu białkowego jest zmieny w zależności od etapu wycinania intronu. Wyróżniamy cztery etapy tego procesu: E, A, B, C (opisany przez Graveley’a w 2000 roku) [1] : | Splacing jest to proces polegający na usuwaniu intronów z pre-mRNA tuż po transkrypcji i połączenia eksonów tak aby dojrzały pre-mRNA przygotowany do translacji kodował ciągły łąńcuch polipeptydowy. Proces ten jest kontrolowany przez obecność określonych sekwencji RNA w intronach i eksonach oraz przez wiele czynników białkowych (naważniejsze to rybonukleproteiny -snRNP: U1, U2, U4, U5, U6). Na nici mRNA powstaje dynamiczny kompleks białkowy nazywany spliceosomem. Uczestniczące w nim białka snRNP rozpoznają trzy sekwencje sygnałowe w intronach: na końcu 5’ (sekwencję GU a dla alternatywnego splicingu AU) i 3’ (sekwencję AG a dla alternatywnego splicingu AC) oraz miejsce rozgałęzienia (nukleotyd adeninowy (A)), tworząc z nimi komplementarne połączenia typu RNA:RNA. Skład kompleksu białkowego jest zmieny w zależności od etapu wycinania intronu. Wyróżniamy cztery etapy tego procesu: E, A, B, C (opisany przez Graveley’a w 2000 roku) [1] : | ||
| − | -etap E- U1 snRNP wiąże się z sekwencją sygnałową 5’, SF1/mBBP z sekwencją rozgałęzienia, a U2AF65 z traktem pirymidynowym (5’-YYYYY-3’), U2AF35 z sekwencją sygnałową 3’ | + | * -etap E- U1 snRNP wiąże się z sekwencją sygnałową 5’, SF1/mBBP z sekwencją rozgałęzienia, a U2AF65 z traktem pirymidynowym (5’-YYYYY-3’), U2AF35 z sekwencją sygnałową 3’ |
| − | -etap A- do miejsca rozgałęzienia dochodzi U2 snRNP | + | * -etap A- do miejsca rozgałęzienia dochodzi U2 snRNP |
| − | -etap B- do miejsca z U2 snRNP dołącza U4/U6●U5 tri-snRNP | + | * -etap B- do miejsca z U2 snRNP dołącza U4/U6●U5 tri-snRNP |
| − | -etap C- U6 snRNP zastępuje U1 snRNP i oddziałuje z U2 snRNP, U5 snRNP znajduje się w poblizu miejsca cięcia, U1 i U4 snRNP ulegają destabilizacji - taki kompleks jest aktywny katalotycznie i umożliwa wycięcie intronu oraz odtworzenie wiązania pomiędzy eksonami. | + | * -etap C- U6 snRNP zastępuje U1 snRNP i oddziałuje z U2 snRNP, U5 snRNP znajduje się w poblizu miejsca cięcia, U1 i U4 snRNP ulegają destabilizacji - taki kompleks jest aktywny katalotycznie i umożliwa wycięcie intronu oraz odtworzenie wiązania pomiędzy eksonami. |
| + | |||
'''BIBLIOGRAFIA''' | '''BIBLIOGRAFIA''' | ||
# Graveley B.R., ”Sorting out the complexity of SR protein functions.” RNA 2000;6:1197-211 | # Graveley B.R., ”Sorting out the complexity of SR protein functions.” RNA 2000;6:1197-211 | ||
Aktualna wersja na dzień 13:09, 27 sie 2013
SPLACING
Splacing jest to proces polegający na usuwaniu intronów z pre-mRNA tuż po transkrypcji i połączenia eksonów tak aby dojrzały pre-mRNA przygotowany do translacji kodował ciągły łąńcuch polipeptydowy. Proces ten jest kontrolowany przez obecność określonych sekwencji RNA w intronach i eksonach oraz przez wiele czynników białkowych (naważniejsze to rybonukleproteiny -snRNP: U1, U2, U4, U5, U6). Na nici mRNA powstaje dynamiczny kompleks białkowy nazywany spliceosomem. Uczestniczące w nim białka snRNP rozpoznają trzy sekwencje sygnałowe w intronach: na końcu 5’ (sekwencję GU a dla alternatywnego splicingu AU) i 3’ (sekwencję AG a dla alternatywnego splicingu AC) oraz miejsce rozgałęzienia (nukleotyd adeninowy (A)), tworząc z nimi komplementarne połączenia typu RNA:RNA. Skład kompleksu białkowego jest zmieny w zależności od etapu wycinania intronu. Wyróżniamy cztery etapy tego procesu: E, A, B, C (opisany przez Graveley’a w 2000 roku) [1] :
- -etap E- U1 snRNP wiąże się z sekwencją sygnałową 5’, SF1/mBBP z sekwencją rozgałęzienia, a U2AF65 z traktem pirymidynowym (5’-YYYYY-3’), U2AF35 z sekwencją sygnałową 3’
- -etap A- do miejsca rozgałęzienia dochodzi U2 snRNP
- -etap B- do miejsca z U2 snRNP dołącza U4/U6●U5 tri-snRNP
- -etap C- U6 snRNP zastępuje U1 snRNP i oddziałuje z U2 snRNP, U5 snRNP znajduje się w poblizu miejsca cięcia, U1 i U4 snRNP ulegają destabilizacji - taki kompleks jest aktywny katalotycznie i umożliwa wycięcie intronu oraz odtworzenie wiązania pomiędzy eksonami.
BIBLIOGRAFIA
- Graveley B.R., ”Sorting out the complexity of SR protein functions.” RNA 2000;6:1197-211