Z BioInf
(→Free Energy Perturbation (FEP)) |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| + | =Free Energy Perturbation (FEP)= | ||
| + | FEP jest jedną z najstarszych ogólnych metod wyznaczania różnic energii swobodnej między układami o zbliżonych właściwościach (np. enzym związany z ligandem X oraz enzym związany z ligandem Y). | ||
| + | W pierwszych zastosowaniach FEP wykorzystywano do względnie prostych układów (np. przy wyznaczaniu energii swobodnej solwatacji jonów), ale jest stosowana do dziś nawet w przypadku najbardziej wymagających problemów (wiązanie białko-ligand, przejścia między stanami). | ||
| + | ==Formalizm== | ||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| + | ==Literatura== | ||
Wersja z 13:18, 5 mar 2015
Free Energy Perturbation (FEP)
FEP jest jedną z najstarszych ogólnych metod wyznaczania różnic energii swobodnej między układami o zbliżonych właściwościach (np. enzym związany z ligandem X oraz enzym związany z ligandem Y). W pierwszych zastosowaniach FEP wykorzystywano do względnie prostych układów (np. przy wyznaczaniu energii swobodnej solwatacji jonów), ale jest stosowana do dziś nawet w przypadku najbardziej wymagających problemów (wiązanie białko-ligand, przejścia między stanami).