Z BioInf
Skocz do: nawigacja, szukaj
Linia 8: Linia 8:
 
!funkcja / przykład
 
!funkcja / przykład
 
|-
 
|-
|A6 K
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |A6 K
 
|Tyr
 
|Tyr
 
|nieznana
 
|nieznana
 
|-
 
|-
|ABC1
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |ABC1
 
|nieznana
 
|nieznana
 
|niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży
 
|niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży
 
|-
 
|-
|alfa
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |alfa
 
|Ser/Thr
 
|Ser/Thr
 
|regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK)
 
|regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK)
 
|-
 
|-
|BCR
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |BCR
 
|Ser/Thr
 
|Ser/Thr
 
|supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3
 
|supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3
 
|-
 
|-
|BRD
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |BRD
 
|nieznana
 
|nieznana
 
|regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy
 
|regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy
 
|-
 
|-
|FAST
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |FAST
 
|Ser/Thr
 
|Ser/Thr
 
|regulacja apoptozy
 
|regulacja apoptozy
 
|-
 
|-
|G11
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |G11
 
|Ser/Thr
 
|Ser/Thr
 
|nieznana
 
|nieznana
 
|-
 
|-
|H11
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |H11
 
|Ser/Thr
 
|Ser/Thr
 
|białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny
 
|białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny
 
|-
 
|-
|PDK
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |PDK
 
|Ser
 
|Ser
 
|regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD)
 
|regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD)
 
|-
 
|-
|PIKK
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |PIKK
 
|Ser/Thr
 
|Ser/Thr
 
|regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji
 
|regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji
 
|-
 
|-
|RIO
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |RIO
 
|Ser
 
|Ser
 
|biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3)
 
|biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3)
 
|-
 
|-
|TAF
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |TAF
 
|Ser/Thr
 
|Ser/Thr
 
|inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID)
 
|inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID)
 
|-
 
|-
|TIF
+
!scope="row" style="background-color:LemonChiffon" |TIF
 
|Ser/Thr
 
|Ser/Thr
 
|regulacja transkrypcji (TIFα, β i γ)
 
|regulacja transkrypcji (TIFα, β i γ)
 
|}
 
|}

Wersja z 10:36, 30 lip 2014

Kinazy atypowe (aPK)

Białka należące do grupy atypowych kinaz białkowych (aPK, ang. atypical protein kinase) pozbawione są motywów sekwencji charakterystycznych dla profilu HMM (ang. hidden Markov model) "typowej" domeny kinazowej. Zostały jednak włączone do grupy aPK ze względu na wyraźną aktywność fosfotransferazową lub też homologię sekwencji. Rodziny atypowych kinaz białkowych są zwykle nieliczne. Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli poniżej.

kinaza specyficzność substratowa funkcja / przykład
A6 K Tyr nieznana
ABC1 nieznana niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży
alfa Ser/Thr regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK)
BCR Ser/Thr supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3
BRD nieznana regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy
FAST Ser/Thr regulacja apoptozy
G11 Ser/Thr nieznana
H11 Ser/Thr białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny
PDK Ser regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD)
PIKK Ser/Thr regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji
RIO Ser biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3)
TAF Ser/Thr inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID)
TIF Ser/Thr regulacja transkrypcji (TIFα, β i γ)