Z BioInf
Skocz do: nawigacja, szukaj
Linia 3: Linia 3:
 
Białka należące do grupy '''atypowych kinaz białkowych''' ('''aPK''', ang. ''<u>a</u>typical <u>p</u>rotein <u>k</u>inase'') pozbawione są motywów sekwencji charakterystycznych dla profilu HMM (ang. ''<u>h</u>idden <u>M</u>arkov <u>m</u>odel'') "typowej" domeny kinazowej. Zostały jednak włączone do grupy aPK ze względu na wyraźną aktywność fosfotransferazową lub też homologię sekwencji. Rodziny atypowych kinaz białkowych są zwykle nieliczne. Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli poniżej.
 
Białka należące do grupy '''atypowych kinaz białkowych''' ('''aPK''', ang. ''<u>a</u>typical <u>p</u>rotein <u>k</u>inase'') pozbawione są motywów sekwencji charakterystycznych dla profilu HMM (ang. ''<u>h</u>idden <u>M</u>arkov <u>m</u>odel'') "typowej" domeny kinazowej. Zostały jednak włączone do grupy aPK ze względu na wyraźną aktywność fosfotransferazową lub też homologię sekwencji. Rodziny atypowych kinaz białkowych są zwykle nieliczne. Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli poniżej.
  
kinaza
+
{
typ
+
!kinaza
funkcja / przykład
+
!specyficzność substratowa
A6 K
+
!funkcja / przykład
Tyr
+
|-
nieznana
+
|A6 K
ABC1
+
|Tyr
ND
+
|nieznana
niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży
+
|-
alfa
+
|ABC1
Ser/Thr
+
|nieznana
regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK)
+
|niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży
BCR
+
|-
Ser/Thr
+
|alfa
supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3
+
|Ser/Thr
BRD
+
|regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK)
ND
+
|-
regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy
+
|BCR
FAST
+
|Ser/Thr
Ser/Thr
+
|supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3
regulacja apoptozy
+
|-
G11
+
|BRD
Ser/Thr
+
|nieznana
nieznana
+
|regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy
H11
+
|-
Ser/Thr
+
|FAST
białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny
+
|Ser/Thr
PDK
+
|regulacja apoptozy
Ser
+
|-
regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD)
+
|G11
PIKK
+
|Ser/Thr
Ser/Thr
+
|nieznana
regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji
+
|-
RIO
+
|H11
Ser
+
|Ser/Thr
biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3)
+
|białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny
TAF
+
|-
Ser/Thr
+
|PDK
inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID)
+
|Ser
TIF
+
|regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD)
Ser/Thr
+
|-
regulacja transkrypcji (TIFa, b i g)
+
|PIKK
 +
|Ser/Thr
 +
|regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji
 +
|-
 +
|RIO
 +
|Ser
 +
|biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3)
 +
|-
 +
|TAF
 +
|Ser/Thr
 +
|inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID)
 +
|-
 +
|TIF
 +
|Ser/Thr
 +
|regulacja transkrypcji (TIF&alpha, &betha i &gamma)
 +
|}

Wersja z 10:30, 30 lip 2014

Kinazy atypowe (aPK)

Białka należące do grupy atypowych kinaz białkowych (aPK, ang. atypical protein kinase) pozbawione są motywów sekwencji charakterystycznych dla profilu HMM (ang. hidden Markov model) "typowej" domeny kinazowej. Zostały jednak włączone do grupy aPK ze względu na wyraźną aktywność fosfotransferazową lub też homologię sekwencji. Rodziny atypowych kinaz białkowych są zwykle nieliczne. Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli poniżej.

{ !kinaza !specyficzność substratowa !funkcja / przykład |- |A6 K |Tyr |nieznana |- |ABC1 |nieznana |niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży |- |alfa |Ser/Thr |regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK) |- |BCR |Ser/Thr |supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3 |- |BRD |nieznana |regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy |- |FAST |Ser/Thr |regulacja apoptozy |- |G11 |Ser/Thr |nieznana |- |H11 |Ser/Thr |białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny |- |PDK |Ser |regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD) |- |PIKK |Ser/Thr |regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji |- |RIO |Ser |biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3) |- |TAF |Ser/Thr |inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID) |- |TIF |Ser/Thr |regulacja transkrypcji (TIF&alpha, &betha i &gamma) |}