Z BioInf
Skocz do: nawigacja, szukaj
Linia 2: Linia 2:
  
 
Białka należące do grupy '''atypowych kinaz białkowych''' ('''aPK''', ang. ''<u>a</u>typical <u>p</u>rotein <u>k</u>inase'') pozbawione są motywów sekwencji charakterystycznych dla profilu HMM (ang. ''<u>h</u>idden <u>M</u>arkov <u>m</u>odel'') "typowej" domeny kinazowej. Zostały jednak włączone do grupy aPK ze względu na wyraźną aktywność fosfotransferazową lub też homologię sekwencji. Rodziny atypowych kinaz białkowych są zwykle nieliczne. Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli poniżej.
 
Białka należące do grupy '''atypowych kinaz białkowych''' ('''aPK''', ang. ''<u>a</u>typical <u>p</u>rotein <u>k</u>inase'') pozbawione są motywów sekwencji charakterystycznych dla profilu HMM (ang. ''<u>h</u>idden <u>M</u>arkov <u>m</u>odel'') "typowej" domeny kinazowej. Zostały jednak włączone do grupy aPK ze względu na wyraźną aktywność fosfotransferazową lub też homologię sekwencji. Rodziny atypowych kinaz białkowych są zwykle nieliczne. Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli poniżej.
 +
 +
kinaza
 +
typ
 +
funkcja / przykład
 +
A6 K
 +
Tyr
 +
nieznana
 +
ABC1
 +
ND
 +
niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży
 +
alfa
 +
Ser/Thr
 +
regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK)
 +
BCR
 +
Ser/Thr
 +
supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3
 +
BRD
 +
ND
 +
regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy
 +
FAST
 +
Ser/Thr
 +
regulacja apoptozy
 +
G11
 +
Ser/Thr
 +
nieznana
 +
H11
 +
Ser/Thr
 +
białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny
 +
PDK
 +
Ser
 +
regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD)
 +
PIKK
 +
Ser/Thr
 +
regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji
 +
RIO
 +
Ser
 +
biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3)
 +
TAF
 +
Ser/Thr
 +
inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID)
 +
TIF
 +
Ser/Thr
 +
regulacja transkrypcji (TIFa, b i g)

Wersja z 10:24, 30 lip 2014

Kinazy atypowe (aPK)

Białka należące do grupy atypowych kinaz białkowych (aPK, ang. atypical protein kinase) pozbawione są motywów sekwencji charakterystycznych dla profilu HMM (ang. hidden Markov model) "typowej" domeny kinazowej. Zostały jednak włączone do grupy aPK ze względu na wyraźną aktywność fosfotransferazową lub też homologię sekwencji. Rodziny atypowych kinaz białkowych są zwykle nieliczne. Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli poniżej.

kinaza

typ

funkcja / przykład A6 K Tyr nieznana ABC1 ND niezbędna do syntezy koenzymu Q u drożdży alfa Ser/Thr regulacja translacji (np. kinaza EF2), kinaza kanału jonowego (TRP-PLIK/ChaK) BCR Ser/Thr supresja szlaku Ras poprzez fosforylację Af-6 i 14-3-3 BRD ND regulacja transkrypcji, kontrola cyklu komórkowego, mejozy FAST Ser/Thr regulacja apoptozy G11 Ser/Thr nieznana H11 Ser/Thr białko szoku cieplnego (H11/HspB8), zawierają domenę a-krystaliny PDK Ser regulacja utleniania pirogronianu (PDK) i a-ketokwasów (BCKD) PIKK Ser/Thr regulacja odpowiedzi na stres (DNA-PK, ATM, ATR, SMG-1) oraz translacji RIO Ser biogeneza rybosomów i regulacja cyklu komórkowego (RIO1, RIO2, RIO3) TAF Ser/Thr inicjacja transkrypcji (TAFII-250/TFIID) TIF Ser/Thr regulacja transkrypcji (TIFa, b i g)