Z BioInf
Skocz do: nawigacja, szukaj
(RFLP)
 
Linia 3: Linia 3:
 
metoda oparta na trawieniu restrykcyjnym fragmentów DNA, które przecinają nić w ściśle określonych miejscach. Istnieje wiele rodzajów restryktaz. Przykłady enzymów i sekwencji, które rozpoznają przedstawia Tabela 1.
 
metoda oparta na trawieniu restrykcyjnym fragmentów DNA, które przecinają nić w ściśle określonych miejscach. Istnieje wiele rodzajów restryktaz. Przykłady enzymów i sekwencji, które rozpoznają przedstawia Tabela 1.
  
[[Image:rflp1.jpg|thumb|center|800px| Tabela 1.(źródło: http://www.e-biotechnologia.pl/Artykuly/Mapowanie-genomow/)]]
+
[[Image:bprflp1.jpg|thumb|center|800px| Tabela 1.(źródło: http://www.e-biotechnologia.pl/Artykuly/Mapowanie-genomow/)]]
  
 
Już zmiana pojedynczego nukleotydu w sekwencji rozpoznawanej przez enzym spowoduje brak cięcia. Bardzo często zmiany miejsc cięcia enzymem wynikają z istnienia polimrofizmów genetycznych, stąd metoda RFLP jest wykorzystywana do porównywania DNA pomiędzy osobnikami i do ustalania pokrewieństwa. W wyniku trawienia enzymem, powstaje różna, charakterystyczna dla danego osobnika, liczba fragmentów DNA, które rozdziela się elektroforetycznie na żelu. Różnica w liczbie i położeniu produktów trawienia pozwala na dokonanie szybkiej analizy porównawczej. Przykładowy wyniki analizy RFLP przedstawia rysunek 1.
 
Już zmiana pojedynczego nukleotydu w sekwencji rozpoznawanej przez enzym spowoduje brak cięcia. Bardzo często zmiany miejsc cięcia enzymem wynikają z istnienia polimrofizmów genetycznych, stąd metoda RFLP jest wykorzystywana do porównywania DNA pomiędzy osobnikami i do ustalania pokrewieństwa. W wyniku trawienia enzymem, powstaje różna, charakterystyczna dla danego osobnika, liczba fragmentów DNA, które rozdziela się elektroforetycznie na żelu. Różnica w liczbie i położeniu produktów trawienia pozwala na dokonanie szybkiej analizy porównawczej. Przykładowy wyniki analizy RFLP przedstawia rysunek 1.
  
[[Image:rflp2.jpg|thumb|center|800px| Rys. 1.(źródło:  http://bio3400.nicerweb.com/Locked/media/ch22/RFLP.html)]]
+
[[Image:bprflp2.jpg|thumb|center|800px| Rys. 1.(źródło:  http://bio3400.nicerweb.com/Locked/media/ch22/RFLP.html)]]

Aktualna wersja na dzień 15:48, 11 cze 2012

RFLP

RFLP z ang. restriction fragments length polymorphism; tzw. polimorfizm miejsc restrykcyjnych metoda oparta na trawieniu restrykcyjnym fragmentów DNA, które przecinają nić w ściśle określonych miejscach. Istnieje wiele rodzajów restryktaz. Przykłady enzymów i sekwencji, które rozpoznają przedstawia Tabela 1.

Już zmiana pojedynczego nukleotydu w sekwencji rozpoznawanej przez enzym spowoduje brak cięcia. Bardzo często zmiany miejsc cięcia enzymem wynikają z istnienia polimrofizmów genetycznych, stąd metoda RFLP jest wykorzystywana do porównywania DNA pomiędzy osobnikami i do ustalania pokrewieństwa. W wyniku trawienia enzymem, powstaje różna, charakterystyczna dla danego osobnika, liczba fragmentów DNA, które rozdziela się elektroforetycznie na żelu. Różnica w liczbie i położeniu produktów trawienia pozwala na dokonanie szybkiej analizy porównawczej. Przykładowy wyniki analizy RFLP przedstawia rysunek 1.