Z BioInf
Skocz do: nawigacja, szukaj
(Kinazy JAK)
(Kinazy JAK)
Linia 1: Linia 1:
 
==Kinazy JAK==
 
==Kinazy JAK==
Kinazy JAK (<u>Ja</u>nus <u>K</u>inase) należą do rodziny eukariotycznych niereceptorowych tyrozynowych kinaz białkowych. Ludzkie kinazy JAK1 oraz JAK2 zostały odkryte przez Wilksa w 1989 roku (Wilks 1898), który zidentyfikował ich sekwencje kodujące w oparciu o tzw. zagnieżdżony PCR. Nowe kinazy zostały wtedy nazwane <u>J</u>ust <u>A</u>nother <u>K</u>inase. Do rodziny kinaz JAK należą również JAK3 oraz TYK2 (<u>Ty</u>rosine <u>K</u>inase 2). Kinazy JAK są białkami wielodomenowymi o ciężarze cząsteczkowym wynoszącym około 120-140 kDa. Ich budowę ilustruje Schemat 1. Sekwencja białek JAK została podzielona na siedem regionów homologii JH1-7 (JAK Homology) z początkiem na C-końcu białek JAK (Wilks 1991). Domena katalityczna ('''JH1''', o ciężarze cząsteczkowym około 40 kDa) znajduje się na C-końcu białka i jest funkcjonalną kinazą tyrozynową. Z domeną JH1 sąsiaduje tzw. domena pseudokinazowa '''JH2'''. Funkcja domeny JH2 polega na negatywnej regulacji aktywności katalitycznej domeny kinazowej. To właśnie te dwie sąsiadujęce ze sobą domeny zaispirowały nazwę kinaz JAK - kinazy Janusa. W starożytnej rzymskiej mitologii Janus był bożkiem początków i przejść, wrót i drzwi, o dwóch twarzach. W części N-końcowej białek JAK zostały zidentyfikowane jeszcze dwie domeny: trzecia '''FERM''' oraz czwarta '''SH2'''. Rola tych domen polega przede wszystkim na asocjacji i kotwiczeniu całego białka do cytoplazmatycznej cześci receptorów cytokin, czynników wzrostu oraz hormonów.
+
Kinazy JAK (<u>Ja</u>nus <u>K</u>inase) należą do rodziny eukariotycznych niereceptorowych tyrozynowych [[kinaz białkowych]]. Ludzkie kinazy JAK1 oraz [[JAK2]] zostały odkryte przez Wilksa w 1989 roku (Wilks 1898), który zidentyfikował ich sekwencje kodujące w oparciu o tzw. zagnieżdżony PCR. Nowe kinazy zostały wtedy nazwane <u>J</u>ust <u>A</u>nother <u>K</u>inase. Do rodziny kinaz JAK należą również JAK3 oraz TYK2 (<u>Ty</u>rosine <u>K</u>inase 2). Kinazy JAK są białkami wielodomenowymi o ciężarze cząsteczkowym wynoszącym około 120-140 kDa. Ich budowę ilustruje Schemat 1. Sekwencja białek JAK została podzielona na siedem regionów homologii JH1-7 (JAK Homology) z początkiem na C-końcu białek JAK (Wilks 1991). Domena katalityczna ('''JH1''', o ciężarze cząsteczkowym około 40 kDa) znajduje się na C-końcu białka i jest funkcjonalną kinazą tyrozynową. Z domeną JH1 sąsiaduje tzw. domena pseudokinazowa '''JH2'''. Funkcja domeny JH2 polega na negatywnej regulacji aktywności katalitycznej domeny kinazowej. To właśnie te dwie sąsiadujęce ze sobą domeny zaispirowały nazwę kinaz JAK - kinazy Janusa. W starożytnej rzymskiej mitologii Janus był bożkiem o dwóch twarzach strzegącym początków i przejść, wrót i drzwi. W części N-końcowej białek JAK zostały zidentyfikowane jeszcze dwie domeny: trzecia '''FERM''' oraz czwarta '''SH2'''. Rola tych domen polega przede wszystkim na asocjacji i kotwiczeniu całego białka do cytoplazmatycznej cześci receptorów cytokin, czynników wzrostu oraz hormonów.
  
 
[[Image: JAK-Rysunek1.png|thumb|center|600px|Schemat 1: Struktura domenowa kinaz JAK, PTK - Protein Tyrosine Kinase, KLD - Kinase-like Domain (żródło: A.F.Wilks ''Seminars in Cell & Developmental Biology'' 19(2008): 319-328)]]
 
[[Image: JAK-Rysunek1.png|thumb|center|600px|Schemat 1: Struktura domenowa kinaz JAK, PTK - Protein Tyrosine Kinase, KLD - Kinase-like Domain (żródło: A.F.Wilks ''Seminars in Cell & Developmental Biology'' 19(2008): 319-328)]]
 +
 +
{Table:
 +
!kinaza JAK
 +
!para tyrozyn
 +
|-
 +
|JAK1
 +
|Tyr1038/Tyr1039
 +
|-
 +
|JAK2
 +
|Tyr1007/Tyr1008
 +
|-
 +
|JAK3
 +
|Tyr980/Tyr981
 +
|-
 +
|TYK2
 +
|Tyr1054/Tyr1055
 +
|}
 +
 +
Ważną częścią struktury kinaz JAK jest pętla aktywacyjna, w której zlokalizowane są chrakterystyczne dla kinaz JAK ewolucyjnie konserwowane '''pary tyrozyn''' (przedstawione w Tabeli 1). Mechanizm aktywacji kinaz JAK opiera się na autofosforylacji tych reszt tyrozyny. Dołączenie rszt fosforanów powoduje otwarcie pętli aktywacyjnej i przesunięcie motywu DFG do konformacji aktywnej ''DFG-in'', zdolnego do wiązania kationów magnezu. Autofosforylacja umożliwia również wiązanie wielu białek regulatorowych, np.: SOCS, PTP. Charakterystyczna dla kinaz JAK jest również tzw. pętla insercyjna również zaangażowana w regulację aktywności fosforylacyjnej tych kinaz (Lucet 2006).

Wersja z 11:36, 8 maj 2014

Kinazy JAK

Kinazy JAK (Janus Kinase) należą do rodziny eukariotycznych niereceptorowych tyrozynowych kinaz białkowych. Ludzkie kinazy JAK1 oraz JAK2 zostały odkryte przez Wilksa w 1989 roku (Wilks 1898), który zidentyfikował ich sekwencje kodujące w oparciu o tzw. zagnieżdżony PCR. Nowe kinazy zostały wtedy nazwane Just Another Kinase. Do rodziny kinaz JAK należą również JAK3 oraz TYK2 (Tyrosine Kinase 2). Kinazy JAK są białkami wielodomenowymi o ciężarze cząsteczkowym wynoszącym około 120-140 kDa. Ich budowę ilustruje Schemat 1. Sekwencja białek JAK została podzielona na siedem regionów homologii JH1-7 (JAK Homology) z początkiem na C-końcu białek JAK (Wilks 1991). Domena katalityczna (JH1, o ciężarze cząsteczkowym około 40 kDa) znajduje się na C-końcu białka i jest funkcjonalną kinazą tyrozynową. Z domeną JH1 sąsiaduje tzw. domena pseudokinazowa JH2. Funkcja domeny JH2 polega na negatywnej regulacji aktywności katalitycznej domeny kinazowej. To właśnie te dwie sąsiadujęce ze sobą domeny zaispirowały nazwę kinaz JAK - kinazy Janusa. W starożytnej rzymskiej mitologii Janus był bożkiem o dwóch twarzach strzegącym początków i przejść, wrót i drzwi. W części N-końcowej białek JAK zostały zidentyfikowane jeszcze dwie domeny: trzecia FERM oraz czwarta SH2. Rola tych domen polega przede wszystkim na asocjacji i kotwiczeniu całego białka do cytoplazmatycznej cześci receptorów cytokin, czynników wzrostu oraz hormonów.

Schemat 1: Struktura domenowa kinaz JAK, PTK - Protein Tyrosine Kinase, KLD - Kinase-like Domain (żródło: A.F.Wilks Seminars in Cell & Developmental Biology 19(2008): 319-328)

{Table: !kinaza JAK !para tyrozyn |- |JAK1 |Tyr1038/Tyr1039 |- |JAK2 |Tyr1007/Tyr1008 |- |JAK3 |Tyr980/Tyr981 |- |TYK2 |Tyr1054/Tyr1055 |}

Ważną częścią struktury kinaz JAK jest pętla aktywacyjna, w której zlokalizowane są chrakterystyczne dla kinaz JAK ewolucyjnie konserwowane pary tyrozyn (przedstawione w Tabeli 1). Mechanizm aktywacji kinaz JAK opiera się na autofosforylacji tych reszt tyrozyny. Dołączenie rszt fosforanów powoduje otwarcie pętli aktywacyjnej i przesunięcie motywu DFG do konformacji aktywnej DFG-in, zdolnego do wiązania kationów magnezu. Autofosforylacja umożliwia również wiązanie wielu białek regulatorowych, np.: SOCS, PTP. Charakterystyczna dla kinaz JAK jest również tzw. pętla insercyjna również zaangażowana w regulację aktywności fosforylacyjnej tych kinaz (Lucet 2006).