Z BioInf
Skocz do: nawigacja, szukaj
(Energia swobodna)
(Energia swobodna)
Linia 9: Linia 9:
 
[[Image:F_uts.png|thumb|center ]]
 
[[Image:F_uts.png|thumb|center ]]
 
czyli potencjału termodynamicznego stosowanego w przypadku układów w kontakcie termicznym z otoczeniem (przy stałej liczbie cząsteczek, N, i stałej objętości, V).
 
czyli potencjału termodynamicznego stosowanego w przypadku układów w kontakcie termicznym z otoczeniem (przy stałej liczbie cząsteczek, N, i stałej objętości, V).
Energia swobodna Helmholtza w powyższej postaci jest funkcją parametrów makroskopowych, przez co jej stosowalność ograniczona jest do układów (również) makroskopowych, tzn. zbudowanych z niewyobrażalnie dużej liczby cząsteczek.
+
Energia swobodna Helmholtza w powyższej postaci ograniczona jest do układów makroskopowych, tzn. zbudowanych z niewyobrażalnie dużej liczby cząsteczek.
Należy podkreślić, że termodynamika fenomenologiczna nie zakłada, że otaczająca nas materia zbudowana jest z atomów, a jedynie postuluje istnienie i właściwości dwuch funkcji: energii wewnętrznej (U) i entropii (S).
+
Należy podkreślić, że termodynamika fenomenologiczna nie zakłada, że otaczająca nas materia zbudowana jest z atomów, a jedynie postuluje istnienie i właściwości dwóch funkcji: energii wewnętrznej (''U'') i entropii (''S'').
 
 
Ponieważ zajmujemy się układami w skali mikro (białka, kwasy nukleinowe itd.), interesować będzie postać energii swobodnej Helmholtza, wynikająca z postulatów mechaniki statystycznej. To znaczy,
 
 
 
[[Image:F_phi2.png|thumb|center ]]
 
 
 
gdzie w miejsce energii wewnętrzenej pojawiła się wartość oczekiwana energii całkowitej względem gęstości prawdopodobieństwa:
 
  
 +
==Postać mikroskopowa energii swobodnej==
 +
Ponieważ zajmujemy się układami w skali mikro (białka, kwasy nukleinowe itd.), interesować nas będzie postać energii swobodnej Helmholtza, wynikająca z postulatów mechaniki statystycznej. To znaczy,
 +
[[Image:F_phi3.png|thumb|center ]]
 +
gdzie w miejsce energii wewnętrzenej pojawiła się wartość oczekiwana energii całkowitej, ''E'', przy gęstości prawdopodobieństwa:
 
[[Image:Boltzmann.png|thumb|center ]]
 
[[Image:Boltzmann.png|thumb|center ]]
 +
zwanej rozkładem Boltzmanna.
 +
Stała ''k'' występująca w powyższych równaniach nosi nazwę stałej Boltzmanna.
  
zwanej rozkładem Boltzmanna
+
Ludwig Boltzmann, twórca jednego z najważniejszych działów fizyki - mechaniki statystycznej - zasłużył się, proponując następującą postać funkcyjną entropii:
 +
[[Image:Entropy.png|thumb|center ]]
  
==Postać mikroskopowa energii swobodnej==
+
Zauważmy, że do wyznaczenia energii swobodnej potrzebna jest znajomość energii całkowitej układu, która jest funkcją położeń, '''x''', i pędów atomów, z których zbudowany jest układ, '''p'''.

Wersja z 10:29, 9 lut 2015

Energia swobodna

Energia swobodna jest wielkością fizyczną przydatną w opisie układów, będących w kontakcie z otoczeniem (tzn. oddziaływujących z nim). Pojęcie to wywodzi się z termodynamiki fenomenologicznej, gdzie służyło m.in. do określenia maksymalnej pracy, jaką można uzyskać ze zgromadzonej w układzie energii (stąd określenie swobodna), przy określonym typie oddziaływań z otoczeniem (termiczne, mechaniczne, materialne). Jednakże energia swobodna (i jej pochodne cząstkowe) pozwala wyznaczyć wszystkie makroskopowe równowagowe własności układu.

Zarys historyczny

W zestawie artykułów Energia swobodna, które znaleźć można w ramach tego wiki, ograniczamy sie do opisu energii swobodnej Helmholtza:

Błąd przy generowaniu miniatury: /bin/bash: /usr/bin/convert: No such file or directory Error code: 127

czyli potencjału termodynamicznego stosowanego w przypadku układów w kontakcie termicznym z otoczeniem (przy stałej liczbie cząsteczek, N, i stałej objętości, V). Energia swobodna Helmholtza w powyższej postaci ograniczona jest do układów makroskopowych, tzn. zbudowanych z niewyobrażalnie dużej liczby cząsteczek. Należy podkreślić, że termodynamika fenomenologiczna nie zakłada, że otaczająca nas materia zbudowana jest z atomów, a jedynie postuluje istnienie i właściwości dwóch funkcji: energii wewnętrznej (U) i entropii (S).

Postać mikroskopowa energii swobodnej

Ponieważ zajmujemy się układami w skali mikro (białka, kwasy nukleinowe itd.), interesować nas będzie postać energii swobodnej Helmholtza, wynikająca z postulatów mechaniki statystycznej. To znaczy,

Błąd przy generowaniu miniatury: /bin/bash: /usr/bin/convert: No such file or directory Error code: 127

gdzie w miejsce energii wewnętrzenej pojawiła się wartość oczekiwana energii całkowitej, E, przy gęstości prawdopodobieństwa:

Błąd przy generowaniu miniatury: /bin/bash: /usr/bin/convert: No such file or directory Error code: 127

zwanej rozkładem Boltzmanna. Stała k występująca w powyższych równaniach nosi nazwę stałej Boltzmanna.

Ludwig Boltzmann, twórca jednego z najważniejszych działów fizyki - mechaniki statystycznej - zasłużył się, proponując następującą postać funkcyjną entropii:

Entropy.png

Zauważmy, że do wyznaczenia energii swobodnej potrzebna jest znajomość energii całkowitej układu, która jest funkcją położeń, x, i pędów atomów, z których zbudowany jest układ, p.