Z BioInf
Skocz do: nawigacja, szukaj

Adaptive Biasing Force

Jedna z nowszych metod wyznaczania różnic energii swobodnej, a konretniej - potencjału średnich sił (PMF), z którego można wyznaczyć różnice energii swobodnej między stanami meta-stabilnymi. Jej główną zaletą jest uniwersalność; do działania wymaga definicji współrzędnej reakcji ξ(x), będącej funkcją konfiguracji układu. Ponadto, ABF jest nieczuły na problemy związane z przeszukiwaniem przestrzeni konfiguracyjnej (utykanie w lokalnych minimach, eksploracja licznych minimów). Do wad należy zaliczyć skomplikowany formalizm i nieintuicyjność, co utrudnia debugowanie.